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尼奥／托玛斯·安德森（Neo）奇洛·李维斯（Keanu
Reeves）饰
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这是个双重身份者。生活中他是一家软件公司的职员，名叫托玛斯·安德森，虚拟世界里他是犯下所有黑客罪行的黑客。人类世界被人类智慧的产物虚拟人控制，莫斐斯等人把尼奥当成了救星。在莫斐斯的游说下，尼奥在上一集里吞下了红色药丸，他要去寻找真相，结束人类和电脑人之间的斗争。在地心深处的锡安镇，仅存的人类生活于此。
这一集中，尼奥又见到了被莫斐斯奉为圣人的祭师，她告诉尼奥有大事要发生，有人要死，他必须去阻止这一切发生。莫斐斯和Trinity被虚拟人抓去，尼奥重新回到现实中，在他们还没有被打死之前救他们回来。
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崔妮蒂（Trinity）嘉莉—安·莫斯（Carrie-Anne
Moss）饰
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在第一集中与尼奥出生入死并肩作战的Trinity，是黑客迷最喜欢的角色之一。对于她而言，尼奥与莫斐斯是她的信心所在，他们的存在支持她生活在这个孤独的世界中。
第二集中，她对尼奥的爱使得她变得无比坚强有力，她已经成为更具战斗力的勇士。她和尼奥所在的世界是阴沉恐怖的，但与此相对,他们的爱才纯洁美好。爱令她得到放松，同时也给予她无尽的力量。不过命运不济，上一集中她逃过了史密斯的围捕，这一集中她将被电脑病毒杀手所伤。 |
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莫斐斯（Morpheus）劳伦斯·费舍伯恩（Laurence
Fishburne）饰
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莫斐斯毕生的任务是在寻找一个能够完成他的意愿、拯救人类的人。在上一集中，在拯救人类的行动中他更像是一个老师，教导别人如何做，而在第二集里，他则成为精神领袖。他一直坚信尼奥就是他要找的人，始终相信祭师的预言必将实现。
不过，在解救被困在锡安的人类而与虚拟人的斗争中他的信仰也受到挑战。越是接近真相，他越是感到迷惑。倒霉的是这一集中他再次被抓，等着他一手训练出来的尼奥来营救他。 |
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尼欧波（Niobe）加达·平克特·史密斯（Jada
PinkettSmith）饰
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第二集中新增了不少角色，无论是母体中还是仅存的人类中。尼欧波是人类中新增的一个至关重要的角色，她是叛舰Logos的指挥官，也是莫斐斯的旧情人。但尼欧波不像莫斐斯等人一样充满了信念，她本身毫无信仰可言，除了她自己外她什么都不相信，她的自我意识膨胀到狂妄自大的地步。
不过有一点值得庆幸的是，她自认自己是个很好的战士，事实上也的确如此，她的凶狠勇猛令她成为非常出色的勇士。也正因为如此，她才得以与拯救人类的使命有了关系。尼欧波将会有不少单人匹马的打斗场面，这是一个满脑子计划、行动快过想法的角色。 |
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特工史密斯（Agent
Smith）雨果·威文（Hugo Weaving）饰
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永远不知疲倦的电脑特工史密斯，仍旧在继续他消灭一切存在于母体内的人类的任务。在第二集中，他开始在执行任务时尝试去感受人类的愤怒与嫉妒，开始探究人类的思想里到底藏有什么秘密。但是他越是有发现，对人类的嫉妒和憎恨便更深。不过这些只是开始，当人类的精神强烈地包围着他的时候，他开始喜欢上做人的乐趣。
他心中的自我逐渐膨胀，最终他几乎被人类的精神所解放。史密斯的角色比前一集复杂，他自己守着一个秘密，这个秘密要到第三集才能揭开。史密斯在第二集中功能更为先进。他化身成100个自己来对付尼奥。不过，他们之间的斗争都要等到最后一集才有胜负之分。 |
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帕西芬（Persephone）莫妮卡·贝鲁奇（Monica
Bellucci）饰
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帕西芬是梅罗文的妻子，也是奸角一名。他们夫妻二人就像是一对吸血鬼，想靠从别人的争斗中渔利。帕西芬看似文雅端庄，实则是老奸巨滑而且异常腐败。她最会利用自己的权力去得到自己想要的东西——感情。
帕西芬的戏份在第二集较多。她是片中看上去稍微有人情味、有感情的角色，不过她一生都不开心，因每一分钟她都感到危机四伏。她被地下世界之王俘虏，只可以有一段时间回到现实世界与母亲见面。她本身不是人类，但当她开始有人类感情之后，她就像一只吸血蝙蝠，四处吸取人类的感情。她与尼奥将会有感情戏，她会以一个意态撩人的姿态去迷惑尼奥，企图以美色去阻碍他的行动。 |
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双胞胎(Twins)内尔/阿德里安·雷蒙(Neil／Adrian
Rayment)饰
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梅罗文的保镖。二人长相相似，形同鬼魅，是这一集中新出现的非常可怕的角色之一。他们长得如同白化病人，留着骇人的长发绺，脚后跟长得出奇。他们是可怕的电脑病毒的产物。邪恶双胞胎最可怕之处不在于他们的长相，而在于他们的超人能力。
和我们通常意义上的电脑上病毒破坏性很大一样，电脑病毒转化而来的电脑人的威力和破坏性也很大。他们可以像史密斯特工等电脑人一样有着多变的神通，甚至可以变成鬼魅的幽灵。他们有一拳一脚打穿墙壁的能力，而且还能够直接穿越墙壁等阻隔。作为保镖，他们有着杀手般的冷酷，至少在预告片中没人看到过他们说话，以致很多人怀疑他们从来就不说话。实际上他们是会说话的，只是比较少，可能是为了扮酷的原故。 |
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梅罗文（Merovingian）兰波特·威尔逊（Lambert
Wilson）饰
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| 和没有信仰但却勇敢与虚拟人作战的尼俄伯相比，第二集中新出现的梅罗文则是一个彻底没用的家伙。他有很多保镖常伴左右，整体沉溺于奢侈享乐的生活。此外，他还受到他迷人的妻子帕西芬的摆布，听之任之，但却无法从妻子那里得到爱。正因为如此他才整天沉迷于外面的情感世界。 |
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林克（Link）哈罗德·佩里纽（Harold
Perrineau）饰
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| 莫斐斯的根据地——那艘飞船中的驾驶员兼话务员坦克，上集中虽然大难不死，但这一集中也无法出现。因为饰演坦克的Marcus
Chong因故没有出现在续集中。新的驾驶员就是这位林克，他的任务仍旧是驾驶飞船以及及时接通电话让大家回到飞船上。而且在片中他还有一个女友Zee与自己一起作战。 |
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祭师（Oracle）
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和第一集中见到尼奥是她能够遇见花瓶将被打碎一样，在续集的故事开始时她又以圣人的身份向尼奥预言将要发生的事。这次的预言是他们这阵营中有人要死，她不会出手阻止，这一重任毫无疑问落到了尼奥的身上。她每次都是只露一面，但这一面却成为故事发展的关键。
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